Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms