Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNDC1Q96C34 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNDC1Q96C34 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms