Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms