Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C7orf43Q8WVR3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C7orf43Q8WVR3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms