Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC12Q8WUD4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC12Q8WUD4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms