Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29Q8TEQ0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms