Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX54Q8TDD1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX54Q8TDD1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms