Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms