Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q71RC1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q71RC1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q71RC1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q71RC1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q71RC1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q71RC1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q71RC1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q71RC1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q71RC1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q71RC1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q71RC1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms