Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBR3Q6ZT12 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms