Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNE3Q6ZMZ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms