Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CASC2Q6XLA1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms