Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms