Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC174Q6PII3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms