Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms