Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC27A3Q5K4L6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A3Q5K4L6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms