Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TDRD12Q587J7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TDRD12Q587J7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms