Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC38Q502W7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms