Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM259Q4ZIN3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM259Q4ZIN3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms