Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEACAM16Q2WEN9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms