Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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