Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SGCAQ16586 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SGCAQ16586 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SGCAQ16586 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SGCAQ16586 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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