Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1EQ15878 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1EQ15878 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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