Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms