Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SEC23BQ15437 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SEC23BQ15437 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SEC23BQ15437 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SEC23BQ15437 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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