Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTF1Q15361 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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