Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRRQ15256 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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PTPRRQ15256 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRRQ15256 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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