Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NCF4Q15080 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NCF4Q15080 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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