Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HNF4GQ14541 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HNF4GQ14541 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HNF4GQ14541 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HNF4GQ14541 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HNF4GQ14541 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HNF4GQ14541 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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HNF4GQ14541 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF4GQ14541 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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