Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALCAMQ13740 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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