Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTCH1Q13635 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTCH1Q13635 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
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