Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SRSF5Q13243 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SRSF5Q13243 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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