Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM27E3Q08E93 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM27E3Q08E93 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms