Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACSM1Q08AH1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACSM1Q08AH1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms