Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
POLEQ07864 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
POLEQ07864 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLEQ07864 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms