Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4BQ07343 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4BQ07343 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms