Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE3AQ05086 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms