Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1BQ00975 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms