Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD1P98174 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FGD1P98174 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD1P98174 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD1P98174 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD1P98174 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms