Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIM1P81133 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIM1P81133 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIM1P81133 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SIM1P81133 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SIM1P81133 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms