Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms