Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2A2P52657 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2A2P52657 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms