Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP6V1E1P36543 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP6V1E1P36543 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms