Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NF2P35240 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NF2P35240 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NF2P35240 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NF2P35240 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NF2P35240 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NF2P35240 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms