Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCND2P30279 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCND2P30279 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCND2P30279 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCND2P30279 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCND2P30279 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCND2P30279 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND2P30279 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND2P30279 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms