Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA6P23229 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms