Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRHP20396 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRHP20396 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRHP20396 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRHP20396 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRHP20396 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
TRHP20396 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRHP20396 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRHP20396 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms