Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FLT1P17948 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLT1P17948 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLT1P17948 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLT1P17948 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FLT1P17948 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FLT1P17948 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FLT1P17948 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLT1P17948 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLT1P17948 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLT1P17948 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLT1P17948 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms