Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VEGFAP15692 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFAP15692 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms