Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRF1P14222 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms